學院現設有化學系、化學工程系和化學生物與制藥系;建有江蘇省化學化工實驗教學示範中心、現代分析測試中心、四個省級研發和人才培養平台(江蘇省分子鐵電科學與應用重點實驗室、江蘇省生物藥物高技術研究重點實驗室、江蘇省光電功能材料工程實驗室、江蘇省富碳材料與器件工程實驗室)、四個研究所(bat365中文官方网站精細化工研究所、bat365中文官方网站制藥工程研究所、bat365中文官方网站有序物質科學研究中心、bat365中文官方网站藥物研究中心)、三個校企聯合研究中心(東大-海昌/海倫(台灣)生物材料工程技術研究中心、東大-中鹽常化新材料研究中心、東大鹽城冬陽生物制品研究中心)以及30多個江蘇省(企業)研究生工作站。
學院科研方向廣泛,涵蓋了精細化工、新能源、新材料、化學生物與制藥等多個領域。學院每年科研經費和發表SCI論文數量均保持較高的增長速度。近5年來,學院承擔了國家863/973課題、國家自然科學基金重點/重大、國際合作、軍工項目、重大研究計劃項目、重大新藥創制項目、國家重大科研儀器研制項目、國家傑出青年基金、國家優秀青年基金、江蘇省重大科技成果轉化項目、江蘇省工業支撐項目、江蘇省産學研前瞻性聯合研究項目等180餘項。
學院科研平台優越,擁有衆多大型儀器設備:穩态瞬态熒光光譜儀(PluoroLog 3-TCSPC)、氣相色譜質譜聯用儀)7890B/5977A)、液質聯用儀(LCMS6120)、多功能光電子能譜儀(XPS-2)、基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜儀(Ultraflextreme)、600M核磁共振波譜儀(AVANCE III HD 600MHz)、場發射掃描電鏡(NanoSEM450)、桌面型掃描電子顯微鏡、液相高分辨飛行時間質譜儀等。
學院科研成果豐碩:榮獲國家自然科學二等獎1項,國家科技進步二等獎1項,教育部自然科學一等獎1項、中華全國工商業聯合會一等獎2項、江蘇預防醫學科技獎二等獎1項及省級各類獎項10餘項。在國際頂級期刊《Science》發表論文3篇,每年在J. Am. Chem. Soc.,Angew. Chem. Int. Ed.,Chem. Rev.,Chem. Soc. Rev.等國際高水平期刊發表SCI論文350餘篇;每年授權國家發明專利百餘項;編寫教材/專著12部;主辦全國性學術期刊《化工時刊》。